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BSP甲基化測序

來源:萬物生物   發(fā)布時(shí)間:2021-11-02

BSP甲基化測序

亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經(jīng)典方法,其原理為:用亞硫酸氫鈉修飾處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶則不變。

基因組DNA經(jīng)亞硫酸鹽處理后,設(shè)計(jì)BSP引物擴(kuò)增目的片段,此時(shí)尿嘧啶(U)全部轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶(T),最后對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序就可以判斷CpG位點(diǎn)是否發(fā)生甲基化。

 

技術(shù)優(yōu)勢

(1) 檢測序列長,可長達(dá)200-400bp

(2) 分辨率高,可檢測到每一個(gè)堿基的甲基化狀況

(3) 對于樣品要求低,適用于新鮮、冷凍和FFPE樣本

 

服務(wù)內(nèi)容

1. 基因組DNABisulfite轉(zhuǎn)化;

2. BSPBisulfite Sequencing PCR)法,包括引物設(shè)計(jì)與合成,TA克隆測序及數(shù)據(jù)分析。

 

樣品要求

(1) 若提供基因組DNA,需≥2μg

(2) 若提供的材料為新鮮組織、血液、細(xì)胞等生物材料,請?zhí)峁┳銐蛱崛?/span>2μg以上基因DNA的材料量

(3) 基于所選擇的DNA甲基化檢測方法,請?zhí)峁┫鄳?yīng)的引物或引物序列

 

BSP服務(wù)完成時(shí)提供

(1) Bisulfite處理的基因組DNA

(2) 實(shí)驗(yàn)報(bào)告(包括BSP產(chǎn)物的直接測序報(bào)告)

(3) 5個(gè)有效的陽性克隆

(4) 空點(diǎn)圖

 

結(jié)果展示

BSP測序圖

 

BSP點(diǎn)狀圖和BSP序列比對

 

BSP柱狀圖

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功能和特性

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